后面的几张专辑延伸了《Freak Out!》的音乐和歌词上的主题,而且Zappa发行专辑的频率很快,仅在1968年一年间就有三张专辑冲击排行榜:《We're Only in It for the Money》对当时的嬉皮文化进行了嘲笑,《Lumpy Gravy》是Zappa与一支交响乐队录制的专辑,《Cruising with Ruben & the Jets》是neo-doo wop风格的音乐。60年代末,Zappa将风格转向了纯器乐的爵士摇滚,表现了他熟练的吉他技巧,因为这种音乐方向上的不合,他与乐队的关系破裂了。1970年,Zappa又重组了一个新的The Mothers乐队,他们的音乐风格更象是少儿不宜的喜剧,71年发行的专辑《Fillmore East》。然而,乐队又短命地解散了,因为Zappa在一次演出中被一个精神错乱的歌迷推到了台下,严重受伤。康复之后,Zappa发行了几张专辑,他又一次组建了The Mothers乐队,这次他自己担任了主唱,风格趋于流行摇滚,73年的专辑《Over-Nite Sensation》是他销量最佳的专辑。70年代末,Zappa开始以自己的唱片公司的名字发行专辑,更多的歌迷象信徒一样被他音乐的幽默和复杂所吸引。
我们不能不提到Zappa的吉他演奏,在与乐队的现场演出中,他的solo占很大的比例。Zappa从不把自己当作一个吉他大师,然而他的《Shut Up 'N Play Your Guitar》三张纯器乐系列专辑却足以显现他在吉他上的深厚功力。他的吉他solo谱子被众多的吉他手学习和研究,其中包括当时与Zappa一起合作的年轻吉他手Steve Vai,Vai在以后个人发展中也运用了很多Zappa的音乐素材。就象Miles Davis周围出现了许多优秀的爵士乐手一样,Zappa的乐队似乎变成了个培训高水平摇滚音乐人的基地。