十二孔陶笛正面有十个指孔，分别由双手的食指、中指、无名指和小指来控制，其中食指要负责两个孔。陶笛背面有两个指孔，由双手的拇指来控制。正面或背面还有一个出音孔，用来发出声音，计算陶笛的孔数只包含指孔，不包括出音孔。吹奏时双手的姆指分别按住背面两个指孔，正面指孔的手指按下图所示摆放，很自然的用手指的指肚部分盖住指孔。
十二孔陶笛采用不同指法可以吹出音域不同音阶。下面的图片是指孔全按住为中音1的指法，这是十二孔陶笛最基本的指法，可以吹出低音6到高音3的音阶。需要说明的是“全按”是不包括食指所负责的那两个小孔的，就是说全按为低音5的指法发出低音5的音时实际上只按住了十个指孔，另两个小孔是放开的。
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十二孔陶笛采用不同指法可以吹出音域不同音阶。下面的指法是全按为低音5的指法，可以吹出低音3到高音1的音阶，可以覆盖大部分的常见的曲子，同样这里的“全按”是不包括食指所负责的那两个小孔的，就是说全按为低音5的指法发出低音5的音时实际上只按住了十个指孔，另两个小孔是放开的。
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