1974年出生于上海，8岁开始学习大提琴，师从其父孙宝淇及石志航女士，四年后在北京音乐厅首次公演。1987年考入中央音乐学院附中，1993年入中央音乐学院本科，师从宋涛教授，其间多次获中央音乐学院大提琴比赛第一名，并于1993年在全国大提琴比赛中获奖。1997年受聘为中央音乐学院大提琴教师，同时为北京首席重奏团及北京弦乐四重奏团成员。曾得到Natalye Shakhovskaya Qilando Cole等著名大提琴家的亲自指导和参加Amadeus四重奏大师班。作为国内最具实力的青年大提琴演奏家，孙晓淇曾先后出访过意大利、瑞士、荷兰、印尼、香港、台湾等国家和地区，深受好评。